Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.1 ms