Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MttpO08601 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MttpO08601 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MttpO08601 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MttpO08601 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MttpO08601 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MttpO08601 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MttpO08601 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MttpO08601 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MttpO08601 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MttpO08601 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MttpO08601 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MttpO08601 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MttpO08601 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MttpO08601 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MttpO08601 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MttpO08601 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MttpO08601 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MttpO08601 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MttpO08601 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MttpO08601 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MttpO08601 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MttpO08601 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MttpO08601 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MttpO08601 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MttpO08601 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MttpO08601 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MttpO08601 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MttpO08601 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MttpO08601 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MttpO08601 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MttpO08601 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MttpO08601 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MttpO08601 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MttpO08601 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MttpO08601 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MttpO08601 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MttpO08601 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MttpO08601 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MttpO08601 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MttpO08601 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MttpO08601 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MttpO08601 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MttpO08601 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MttpO08601 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MttpO08601 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MttpO08601 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MttpO08601 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MttpO08601 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MttpO08601 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MttpO08601 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MttpO08601 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MttpO08601 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MttpO08601 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MttpO08601 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MttpO08601 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MttpO08601 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MttpO08601 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MttpO08601 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MttpO08601 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MttpO08601 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MttpO08601 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MttpO08601 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MttpO08601 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MttpO08601 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MttpO08601 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MttpO08601 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MttpO08601 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MttpO08601 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MttpO08601 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MttpO08601 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MttpO08601 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MttpO08601 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MttpO08601 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MttpO08601 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MttpO08601 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MttpO08601 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MttpO08601 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MttpO08601 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MttpO08601 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MttpO08601 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MttpO08601 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MttpO08601 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms