Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna4O08542 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna4O08542 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna4O08542 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna4O08542 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna4O08542 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efna4O08542 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efna4O08542 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efna4O08542 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Efna4O08542 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna4O08542 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna4O08542 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna4O08542 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna4O08542 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Efna4O08542 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efna4O08542 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efna4O08542 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efna4O08542 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efna4O08542 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efna4O08542 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna4O08542 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna4O08542 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna4O08542 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna4O08542 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna4O08542 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna4O08542 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna4O08542 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efna4O08542 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna4O08542 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna4O08542 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna4O08542 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna4O08542 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna4O08542 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna4O08542 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna4O08542 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna4O08542 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efna4O08542 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna4O08542 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna4O08542 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna4O08542 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna4O08542 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna4O08542 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efna4O08542 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna4O08542 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna4O08542 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna4O08542 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efna4O08542 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna4O08542 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna4O08542 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efna4O08542 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efna4O08542 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna4O08542 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna4O08542 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna4O08542 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms