Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17577J3QNF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17577J3QNF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17577J3QNF7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17577J3QNF7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17577J3QNF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17577J3QNF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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