Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp994J3QM38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp994J3QM38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp994J3QM38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp994J3QM38 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp994J3QM38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp994J3QM38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp994J3QM38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp994J3QM38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms