Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem200cJ3QK46 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem200cJ3QK46 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem200cJ3QK46 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem200cJ3QK46 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem200cJ3QK46 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem200cJ3QK46 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem200cJ3QK46 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem200cJ3QK46 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms