Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21060J3KMU4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21060J3KMU4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm21060J3KMU4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21060J3KMU4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21060J3KMU4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21060J3KMU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21060J3KMU4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21060J3KMU4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21060J3KMU4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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