Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn20G5E8X0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn20G5E8X0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn20G5E8X0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn20G5E8X0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn20G5E8X0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn20G5E8X0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn20G5E8X0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn20G5E8X0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn20G5E8X0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn20G5E8X0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn20G5E8X0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn20G5E8X0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn20G5E8X0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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