Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2610028H24RikG5E8K1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2610028H24RikG5E8K1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2610028H24RikG5E8K1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
2610028H24RikG5E8K1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2610028H24RikG5E8K1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
2610028H24RikG5E8K1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610028H24RikG5E8K1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610028H24RikG5E8K1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2610028H24RikG5E8K1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms