Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms