Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm44G3UW88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm44G3UW88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm44G3UW88 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm44G3UW88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm44G3UW88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm44G3UW88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm44G3UW88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm44G3UW88 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms