Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20604F8WIA3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20604F8WIA3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20604F8WIA3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20604F8WIA3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20604F8WIA3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20604F8WIA3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20604F8WIA3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20604F8WIA3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20604F8WIA3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20604F8WIA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20604F8WIA3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms