Protein–RNA interactions for Protein: F7D3W5

Gm45837, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45837F7D3W5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm45837F7D3W5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm45837F7D3W5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm45837F7D3W5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm45837F7D3W5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm45837F7D3W5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm45837F7D3W5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm45837F7D3W5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm45837F7D3W5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm45837F7D3W5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm45837F7D3W5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm45837F7D3W5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm45837F7D3W5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm45837F7D3W5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm45837F7D3W5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm45837F7D3W5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm45837F7D3W5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm45837F7D3W5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm45837F7D3W5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm45837F7D3W5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm45837F7D3W5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm45837F7D3W5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm45837F7D3W5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm45837F7D3W5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm45837F7D3W5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms