Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28048F7BCN0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm28048F7BCN0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28048F7BCN0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28048F7BCN0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28048F7BCN0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28048F7BCN0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28048F7BCN0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28048F7BCN0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms