Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8005F6YKY3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8005F6YKY3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8005F6YKY3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8005F6YKY3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8005F6YKY3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8005F6YKY3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8005F6YKY3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8005F6YKY3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8005F6YKY3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8005F6YKY3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8005F6YKY3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8005F6YKY3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8005F6YKY3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8005F6YKY3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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