Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SmgcF6VRN1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SmgcF6VRN1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SmgcF6VRN1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SmgcF6VRN1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SmgcF6VRN1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SmgcF6VRN1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SmgcF6VRN1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SmgcF6VRN1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SmgcF6VRN1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SmgcF6VRN1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SmgcF6VRN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SmgcF6VRN1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SmgcF6VRN1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SmgcF6VRN1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SmgcF6VRN1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SmgcF6VRN1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SmgcF6VRN1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SmgcF6VRN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SmgcF6VRN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SmgcF6VRN1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms