Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm17555F6U8B9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm17555F6U8B9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm17555F6U8B9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17555F6U8B9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm17555F6U8B9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm17555F6U8B9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm17555F6U8B9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm17555F6U8B9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17555F6U8B9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17555F6U8B9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm17555F6U8B9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm17555F6U8B9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17555F6U8B9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms