Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc6F2Z461 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc6F2Z461 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc6F2Z461 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc6F2Z461 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc6F2Z461 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc6F2Z461 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc6F2Z461 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Herc6F2Z461 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms