Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Raph1F2Z3U3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Raph1F2Z3U3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Raph1F2Z3U3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Raph1F2Z3U3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Raph1F2Z3U3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Raph1F2Z3U3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Raph1F2Z3U3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Raph1F2Z3U3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Raph1F2Z3U3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Raph1F2Z3U3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Raph1F2Z3U3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Raph1F2Z3U3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Raph1F2Z3U3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raph1F2Z3U3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms