Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptar1E9QAB6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptar1E9QAB6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptar1E9QAB6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptar1E9QAB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptar1E9QAB6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptar1E9QAB6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptar1E9QAB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptar1E9QAB6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptar1E9QAB6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptar1E9QAB6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptar1E9QAB6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptar1E9QAB6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptar1E9QAB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms