Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms