Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Srsf11E9Q6E5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srsf11E9Q6E5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srsf11E9Q6E5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srsf11E9Q6E5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srsf11E9Q6E5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srsf11E9Q6E5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Srsf11E9Q6E5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Srsf11E9Q6E5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Srsf11E9Q6E5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srsf11E9Q6E5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srsf11E9Q6E5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Srsf11E9Q6E5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srsf11E9Q6E5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srsf11E9Q6E5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Srsf11E9Q6E5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srsf11E9Q6E5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srsf11E9Q6E5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srsf11E9Q6E5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Srsf11E9Q6E5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Srsf11E9Q6E5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms