Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nolc1E9Q5C9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nolc1E9Q5C9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nolc1E9Q5C9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nolc1E9Q5C9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nolc1E9Q5C9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nolc1E9Q5C9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nolc1E9Q5C9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nolc1E9Q5C9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nolc1E9Q5C9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nolc1E9Q5C9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nolc1E9Q5C9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nolc1E9Q5C9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nolc1E9Q5C9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nolc1E9Q5C9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nolc1E9Q5C9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nolc1E9Q5C9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nolc1E9Q5C9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nolc1E9Q5C9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nolc1E9Q5C9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nolc1E9Q5C9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nolc1E9Q5C9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nolc1E9Q5C9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nolc1E9Q5C9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Nolc1E9Q5C9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nolc1E9Q5C9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nolc1E9Q5C9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nolc1E9Q5C9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nolc1E9Q5C9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nolc1E9Q5C9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nolc1E9Q5C9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Nolc1E9Q5C9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nolc1E9Q5C9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nolc1E9Q5C9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nolc1E9Q5C9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nolc1E9Q5C9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nolc1E9Q5C9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nolc1E9Q5C9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms