Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20518E9Q548 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20518E9Q548 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20518E9Q548 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20518E9Q548 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20518E9Q548 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20518E9Q548 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20518E9Q548 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20518E9Q548 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20518E9Q548 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20518E9Q548 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20518E9Q548 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20518E9Q548 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20518E9Q548 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20518E9Q548 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20518E9Q548 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms