Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup153E9Q3G8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nup153E9Q3G8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup153E9Q3G8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Nup153E9Q3G8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Nup153E9Q3G8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup153E9Q3G8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nup153E9Q3G8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup153E9Q3G8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup153E9Q3G8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nup153E9Q3G8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup153E9Q3G8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup153E9Q3G8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nup153E9Q3G8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nup153E9Q3G8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nup153E9Q3G8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nup153E9Q3G8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nup153E9Q3G8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nup153E9Q3G8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nup153E9Q3G8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nup153E9Q3G8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nup153E9Q3G8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nup153E9Q3G8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nup153E9Q3G8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nup153E9Q3G8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup153E9Q3G8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nup153E9Q3G8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Nup153E9Q3G8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup153E9Q3G8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Nup153E9Q3G8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup153E9Q3G8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup153E9Q3G8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nup153E9Q3G8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nup153E9Q3G8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nup153E9Q3G8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nup153E9Q3G8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nup153E9Q3G8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nup153E9Q3G8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nup153E9Q3G8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nup153E9Q3G8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup153E9Q3G8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nup153E9Q3G8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nup153E9Q3G8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nup153E9Q3G8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nup153E9Q3G8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Nup153E9Q3G8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Nup153E9Q3G8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nup153E9Q3G8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nup153E9Q3G8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Nup153E9Q3G8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nup153E9Q3G8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nup153E9Q3G8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nup153E9Q3G8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nup153E9Q3G8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nup153E9Q3G8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms