Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aldh3b2E9Q3E1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh3b2E9Q3E1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh3b2E9Q3E1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh3b2E9Q3E1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh3b2E9Q3E1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh3b2E9Q3E1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b2E9Q3E1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms