Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E430018J23RikE9PZQ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E430018J23RikE9PZQ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E430018J23RikE9PZQ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E430018J23RikE9PZQ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E430018J23RikE9PZQ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E430018J23RikE9PZQ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E430018J23RikE9PZQ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E430018J23RikE9PZQ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
E430018J23RikE9PZQ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms