Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gcom1E9PZ54 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gcom1E9PZ54 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcom1E9PZ54 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcom1E9PZ54 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcom1E9PZ54 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gcom1E9PZ54 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gcom1E9PZ54 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcom1E9PZ54 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gcom1E9PZ54 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gcom1E9PZ54 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcom1E9PZ54 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcom1E9PZ54 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcom1E9PZ54 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gcom1E9PZ54 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gcom1E9PZ54 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcom1E9PZ54 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gcom1E9PZ54 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gcom1E9PZ54 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcom1E9PZ54 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gcom1E9PZ54 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gcom1E9PZ54 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gcom1E9PZ54 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gcom1E9PZ54 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms