Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkhd1E9PZ36 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkhd1E9PZ36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkhd1E9PZ36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkhd1E9PZ36 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkhd1E9PZ36 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkhd1E9PZ36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkhd1E9PZ36 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkhd1E9PZ36 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkhd1E9PZ36 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkhd1E9PZ36 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkhd1E9PZ36 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkhd1E9PZ36 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkhd1E9PZ36 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms