Protein–RNA interactions for Protein: E9PY60

Vmn1r77, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r77E9PY60 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r77E9PY60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r77E9PY60 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r77E9PY60 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r77E9PY60 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r77E9PY60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vmn1r77E9PY60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r77E9PY60 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r77E9PY60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms