Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl3lE9PWZ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl3lE9PWZ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl3lE9PWZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl3lE9PWZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl3lE9PWZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl3lE9PWZ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpl3lE9PWZ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl3lE9PWZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3lE9PWZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl3lE9PWZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl3lE9PWZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms