Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Rsf1E9PWW9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Rsf1E9PWW9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Rsf1E9PWW9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Rsf1E9PWW9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Rsf1E9PWW9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Rsf1E9PWW9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Rsf1E9PWW9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Rsf1E9PWW9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Rsf1E9PWW9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Rsf1E9PWW9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Rsf1E9PWW9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Rsf1E9PWW9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Rsf1E9PWW9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rsf1E9PWW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Rsf1E9PWW9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Rsf1E9PWW9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rsf1E9PWW9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Rsf1E9PWW9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Rsf1E9PWW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
Rsf1E9PWW9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rsf1E9PWW9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Rsf1E9PWW9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Rsf1E9PWW9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Rsf1E9PWW9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rsf1E9PWW9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rsf1E9PWW9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Rsf1E9PWW9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Rsf1E9PWW9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rsf1E9PWW9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Rsf1E9PWW9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Rsf1E9PWW9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rsf1E9PWW9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Rsf1E9PWW9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Rsf1E9PWW9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Rsf1E9PWW9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Rsf1E9PWW9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Rsf1E9PWW9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
Rsf1E9PWW9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Rsf1E9PWW9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Rsf1E9PWW9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Rsf1E9PWW9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Rsf1E9PWW9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Rsf1E9PWW9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Rsf1E9PWW9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Rsf1E9PWW9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Rsf1E9PWW9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Rsf1E9PWW9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Rsf1E9PWW9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Rsf1E9PWW9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Rsf1E9PWW9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Rsf1E9PWW9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Rsf1E9PWW9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Rsf1E9PWW9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Rsf1E9PWW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Rsf1E9PWW9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
Rsf1E9PWW9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC43.55■■■■■ 4.56
Rsf1E9PWW9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rsf1E9PWW9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rsf1E9PWW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Rsf1E9PWW9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rsf1E9PWW9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
Rsf1E9PWW9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms