Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG6

Ncapg, Non-SMC condensin I complex, subunit G, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcapgE9PWG6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NcapgE9PWG6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NcapgE9PWG6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NcapgE9PWG6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NcapgE9PWG6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NcapgE9PWG6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NcapgE9PWG6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NcapgE9PWG6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NcapgE9PWG6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NcapgE9PWG6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NcapgE9PWG6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NcapgE9PWG6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NcapgE9PWG6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NcapgE9PWG6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NcapgE9PWG6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NcapgE9PWG6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NcapgE9PWG6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NcapgE9PWG6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NcapgE9PWG6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NcapgE9PWG6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NcapgE9PWG6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NcapgE9PWG6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NcapgE9PWG6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NcapgE9PWG6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NcapgE9PWG6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NcapgE9PWG6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NcapgE9PWG6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NcapgE9PWG6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NcapgE9PWG6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NcapgE9PWG6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.7 ms