Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc62E9PVD1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc62E9PVD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc62E9PVD1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc62E9PVD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc62E9PVD1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc62E9PVD1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc62E9PVD1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc62E9PVD1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc62E9PVD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc62E9PVD1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc62E9PVD1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc62E9PVD1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc62E9PVD1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc62E9PVD1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms