Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms