Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3543D3Z235 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3543D3Z235 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3543D3Z235 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3543D3Z235 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3543D3Z235 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3543D3Z235 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3543D3Z235 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3543D3Z235 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3543D3Z235 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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