Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930467E23RikD3Z1P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930467E23RikD3Z1P8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930467E23RikD3Z1P8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930467E23RikD3Z1P8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930467E23RikD3Z1P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms