Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc8D3YZV8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc8D3YZV8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc8D3YZV8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc8D3YZV8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc8D3YZV8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc8D3YZV8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc8D3YZV8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc8D3YZV8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc8D3YZV8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc8D3YZV8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc8D3YZV8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc8D3YZV8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc8D3YZV8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc8D3YZV8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc8D3YZV8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc8D3YZV8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc8D3YZV8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc8D3YZV8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc8D3YZV8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc8D3YZV8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc8D3YZV8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc8D3YZV8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms