Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700015F17RikD3YUK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700015F17RikD3YUK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700015F17RikD3YUK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700015F17RikD3YUK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700015F17RikD3YUK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
1700015F17RikD3YUK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700015F17RikD3YUK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.7 ms