Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip3B9EHT4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip3B9EHT4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip3B9EHT4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip3B9EHT4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clip3B9EHT4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip3B9EHT4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip3B9EHT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip3B9EHT4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms