Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfia4B8QI36 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppfia4B8QI36 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfia4B8QI36 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfia4B8QI36 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfia4B8QI36 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfia4B8QI36 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfia4B8QI36 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfia4B8QI36 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms