Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gabrr3B2RXA8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabrr3B2RXA8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabrr3B2RXA8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabrr3B2RXA8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrr3B2RXA8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrr3B2RXA8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrr3B2RXA8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabrr3B2RXA8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrr3B2RXA8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gabrr3B2RXA8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabrr3B2RXA8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabrr3B2RXA8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms