Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rd3lB2RV38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rd3lB2RV38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3lB2RV38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rd3lB2RV38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rd3lB2RV38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rd3lB2RV38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rd3lB2RV38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rd3lB2RV38 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rd3lB2RV38 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rd3lB2RV38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3lB2RV38 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3lB2RV38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rd3lB2RV38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms