Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf3B2RQG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf3B2RQG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf3B2RQG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf3B2RQG2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf3B2RQG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf3B2RQG2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf3B2RQG2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf3B2RQG2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phf3B2RQG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf3B2RQG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf3B2RQG2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Phf3B2RQG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf3B2RQG2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf3B2RQG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf3B2RQG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf3B2RQG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf3B2RQG2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Phf3B2RQG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms