Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1B2KF50 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1B2KF50 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Uhrf1bp1B2KF50 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1B2KF50 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1B2KF50 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1B2KF50 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1B2KF50 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1B2KF50 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1B2KF50 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1B2KF50 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Uhrf1bp1B2KF50 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Uhrf1bp1B2KF50 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Uhrf1bp1B2KF50 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1B2KF50 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Uhrf1bp1B2KF50 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms