Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brpf3B2KF05 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Brpf3B2KF05 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brpf3B2KF05 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brpf3B2KF05 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf3B2KF05 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf3B2KF05 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brpf3B2KF05 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brpf3B2KF05 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brpf3B2KF05 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brpf3B2KF05 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brpf3B2KF05 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brpf3B2KF05 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brpf3B2KF05 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brpf3B2KF05 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brpf3B2KF05 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brpf3B2KF05 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brpf3B2KF05 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brpf3B2KF05 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brpf3B2KF05 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brpf3B2KF05 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brpf3B2KF05 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.4 ms