Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV3

Lao1, Amine oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lao1B1ARV3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lao1B1ARV3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lao1B1ARV3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lao1B1ARV3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lao1B1ARV3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lao1B1ARV3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lao1B1ARV3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lao1B1ARV3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lao1B1ARV3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lao1B1ARV3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms