Protein–RNA interactions for Protein: A2RST7

Vmn1r9, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r9A2RST7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r9A2RST7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r9A2RST7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r9A2RST7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r9A2RST7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r9A2RST7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r9A2RST7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r9A2RST7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r9A2RST7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r9A2RST7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r9A2RST7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r9A2RST7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r9A2RST7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r9A2RST7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r9A2RST7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms