Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4aA2BI40 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xlr4aA2BI40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xlr4aA2BI40 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xlr4aA2BI40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xlr4aA2BI40 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4aA2BI40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr4aA2BI40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4aA2BI40 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xlr4aA2BI40 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms