Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pramef17A2ASJ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pramef17A2ASJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pramef17A2ASJ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pramef17A2ASJ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pramef17A2ASJ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pramef17A2ASJ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pramef17A2ASJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pramef17A2ASJ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pramef17A2ASJ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pramef17A2ASJ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pramef17A2ASJ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pramef17A2ASJ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pramef17A2ASJ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pramef17A2ASJ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pramef17A2ASJ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pramef17A2ASJ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pramef17A2ASJ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pramef17A2ASJ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pramef17A2ASJ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pramef17A2ASJ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pramef17A2ASJ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pramef17A2ASJ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pramef17A2ASJ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pramef17A2ASJ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Pramef17A2ASJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pramef17A2ASJ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pramef17A2ASJ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pramef17A2ASJ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pramef17A2ASJ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pramef17A2ASJ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pramef17A2ASJ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pramef17A2ASJ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramef17A2ASJ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramef17A2ASJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pramef17A2ASJ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pramef17A2ASJ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pramef17A2ASJ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pramef17A2ASJ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pramef17A2ASJ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pramef17A2ASJ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms