Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgr4A2ARI4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lgr4A2ARI4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr4A2ARI4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr4A2ARI4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lgr4A2ARI4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgr4A2ARI4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgr4A2ARI4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgr4A2ARI4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lgr4A2ARI4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgr4A2ARI4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgr4A2ARI4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr4A2ARI4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr4A2ARI4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr4A2ARI4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms